Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARFGAP3Q9NP61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms