Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC2Q9H6S0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms