Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX5Q9H2C1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms