Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms