Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms