Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD3Q9BZ95 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
NSD3Q9BZ95 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSD3Q9BZ95 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms