Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC4A5Q9BY07 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms