Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP4Q9BWG4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms