Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP58Q9BVL2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP58Q9BVL2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms