Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THUMPD2Q9BTF0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THUMPD2Q9BTF0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms