Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RBM42Q9BTD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM42Q9BTD8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms