Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSEN34Q9BSV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN34Q9BSV6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms