Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms