Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGRRF1Q99675 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGRRF1Q99675 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CGRRF1Q99675 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGRRF1Q99675 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms