Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD9AQ99638 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms