Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS8Q99627 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms