Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRBNQ96SW2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms