Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNAQ96QF7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNAQ96QF7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms