Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms