Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
FAM227BQ96M60 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms