Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD1Q96JS3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms