Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR1Q96JP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms