Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms