Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX11Q96FC9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms