Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPRY1Q96DX4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPRY1Q96DX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RSPRY1Q96DX4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSPRY1Q96DX4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms