Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms