Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms