Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTTNBP2Q8WZ74 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms