Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms