Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSKUQ8WUA8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms