Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms