Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF548Q8NEK5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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