Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL3Q8ND23 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms