Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF1Q8N6C5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms