Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC43Q8N309 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms