Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms