Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms