Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP1Q7RTM1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP1Q7RTM1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms