Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms