Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms