Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTR9Q6PD62 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTR9Q6PD62 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms