Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CLQ60I27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms