Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOCADQ5VW36 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms