Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AGAP6Q5VW22 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms