Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP350Q5VT06 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms