Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COLEC12Q5KU26 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms