Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP13A4Q4VNC1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms