Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPEL1Q2QD12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPEL1Q2QD12 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms