Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MSMPQ1L6U9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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