Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA9Q16790 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CA9Q16790 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CA9Q16790 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CA9Q16790 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CA9Q16790 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CA9Q16790 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CA9Q16790 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CA9Q16790 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CA9Q16790 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CA9Q16790 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CA9Q16790 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CA9Q16790 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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